独具特色的地理条件为遂宁提供较为丰富的自然资源。储量较多的矿藏主要有石油、天然气、盐、沙金、石灰石等，其中天然气和盐卤资源最为丰富。遂宁磨溪气田已探明的天然气可开采储量4403亿立方米，技术可开采储量为3082亿立方米，日产天然气2400万—2700万立方米，是四川省大型气田之一。盐卤地质储量为42亿多吨。
遂宁河流众多，境内流域面积在100平方公里以上的河流有涪江、琼江、郪江、梓江等15条。涪江全长776公里，流经遂宁境内的有171公里。涪江支流呈树枝状分布，境内流域面积5085.9平方公里，占全市面积的95.51%。丘陵低山的地貌形成较大落差，使众多的河流为遂宁提供充足的水能资源，其中境内涪江段是水能集中的主要河段，至2019年，在干流上已建有金华、螺丝池、红江、龙凤、小白塔、过军渡、白禅寺7处中小型水电站。
遂宁总耕地面积30.54万公顷，其中紫色土面积最大。生物资源门类繁多。境内发现并利用的生物资源有1500余个品种或品系，其中植物资源1000余种，农作物栽培品种300余个。盛产粮、棉、油、果、桑、蔗等，是四川粮食、棉花、油料、生猪、水果、蔬菜、中药材的重要生产基地。船山区因盛产菊花芯白芷而成为全国有名的“白芷之乡”。大英县河边镇所产的“白柠檬”，品质优良，为国内独有之物。
遂宁属亚热带常绿阔叶林区，森林覆盖面积31.6%，是全省第一个绿化达标市。林木品种437种，其中有不少是国家保护植物和珍稀树木。如有“活化石”之称的水杉、银杏，名贵的苏铁、红豆杉、马桂木和独具特色的古柏、榕树等。经济林主要有油桐、油橄榄、乌桕、核桃、蓖麻、棕榈等树种。境内盛产柑橘、橙、柚、梨、桃、李、苹果，其中以沙田柚、青苹、红橘、贡橙等品种质量最为优良，享誉省内外。动物资源门类繁多，主要脊椎动物有237种。鱼类资源96种，珍稀动物如鱼类的中华鲟、胭脂鱼、岩原鲤、长吻鮠等，两栖动物中的大鲵，哺乳动物中的水獭，均属国家和省级保护动物。